环境污染犯罪往往并非单独实施，部分未直接参与排放、倾倒、处置有毒有害污染物的行为人，可能以 “不知情” 为借口逃避责任，但主观故意通常会通过客观行为体现。《2019 年纪要》明确：犯罪嫌疑人、被告人是否具有环境污染犯罪的故意，需依据其任职情况、职业经历、专业背景、培训经历、本人因同类行为受到行政处罚或刑事追究的情况，以及污染物种类、污染方式、资金流向等证据，结合其供述综合分析判断。
有下列情形之一的，足以推断行为人存在故意的主观心态：
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企业未依法通过环境影响评价，或未依法取得排污许可证却排放污染物；或者已通过环境影响评价且防治污染设施验收合格后，擅自更改工艺流程、原辅材料，导致产生新的污染物质的。
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不使用验收合格的防治污染设施，或不按规范要求使用的。
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防治污染设施发生故障，发现后不及时排除，继续生产并放任污染物排放的。
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被生态环境部门责令限制生产、停产整治或予以行政处罚后，仍继续生产并放任污染物排放的。
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将危险废物委托第三方处置时，未履行查验对方经营许可的义务，或委托处置费用明显低于市场价格或处置成本的。
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通过暗管、渗井、渗坑、裂隙、溶洞、灌注等逃避监管的方式排放污染物的。
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通过篡改、伪造监测数据逃避监管的。
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其他足以认定存在主观故意的情形。
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